蛋白質(zhì)序列中的關聯(lián)規(guī)則發(fā)現(xiàn)及其應用

隨著蛋白質(zhì)序列-結(jié)構(gòu)分析中使用的機器學習算法越來越復雜,其結(jié)果的解釋和發(fā)現(xiàn)過程也隨之復雜化,因此有必要尋找簡單且理論上可靠的方法.通過引入原理簡單、理論可靠、結(jié)果具有很強實際意義的關聯(lián)規(guī)則發(fā)現(xiàn)算法,找到了蛋白質(zhì)序列中數(shù)以萬計的模式.結(jié)合實例演示了如何將這些模式應用于蛋白質(zhì)序列分析中,如保守區(qū)域發(fā)現(xiàn)、二級結(jié)構(gòu)預測等.同時根據(jù)這些結(jié)果構(gòu)建了一個二級結(jié)構(gòu)規(guī)則庫和一種簡單的二級結(jié)構(gòu)預測算法,實驗結(jié)果表明,約81%的二級結(jié)構(gòu)可以由至少一條關聯(lián)規(guī)則預測得到.

作 者：   作者單位：   刊 名： 生物物理學報  ISTIC PKU 英文刊名： ACTA BIOPHYSICA SINICA  年，卷(期)： 2006 22(3)  分類號： Q5  關鍵詞： 蛋白質(zhì)序列   關聯(lián)規(guī)則   二級結(jié)構(gòu)預測   模式發(fā)現(xiàn)  

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