東北林蛙皮膚中一類新抗菌肽cDNA的克隆及成熟肽的預(yù)測(cè)

為進(jìn)一步研究和開(kāi)發(fā)高效廣譜天然抗生素的抗菌肽,本文克隆東北林蛙(Rana dybowskii)的抗菌肽基因,并預(yù)測(cè)其成熟肽的有關(guān)性質(zhì).根據(jù)蛙屬抗茵肽信號(hào)肽末端序列設(shè)計(jì)簡(jiǎn)并引物,以RT-PCR技術(shù)擴(kuò)增皮膚中抗菌肽的cDNA,并進(jìn)行克隆測(cè)序.用生物信息學(xué)軟件分析cDNA序列特點(diǎn),預(yù)測(cè)成熟肽的理化性質(zhì).研究發(fā)現(xiàn)一種長(zhǎng)度為28個(gè)氨基酸殘基的新抗茵肽dybowsin-1,該肽具有Rana box結(jié)構(gòu);與已發(fā)現(xiàn)的抗茵肽僅有35%的同源性;理論等電點(diǎn)在9.70-10.01之間;均呈陽(yáng)離子性;從第3或4個(gè)氨基酸開(kāi)始到第16個(gè)氨基酸形成α-螺旋結(jié)構(gòu),極性氨基酸位于螺旋輪的一側(cè),非極性氨基酸位于螺旋輪的另一側(cè);具有N-端疏水、C-端親水的兩親性.一個(gè)個(gè)體表達(dá)5條cDNA序列編碼3種不同的dybowsin-1分子,顯示出該抗菌肽表達(dá)的多樣性.序列分析顯示,該抗茵肽可能由多基因座位編碼.

作 者： 朱倩 徐艷春 肖向紅 ZHU Qian XU Yan-chun XIAO Xiang-hong   作者單位： 朱倩,徐艷春,ZHU Qian,XU Yan-chun(東北林業(yè)大學(xué)野生動(dòng)物資源學(xué)院,黑龍江,哈爾濱,150040;國(guó)家林業(yè)局野生動(dòng)植物檢測(cè)中心,黑龍江,哈爾濱,150040)

肖向紅,XIAO Xiang-hong(東北林業(yè)大學(xué)野生動(dòng)物資源學(xué)院,黑龍江,哈爾濱,150040) 

刊 名： 現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展  ISTIC 英文刊名： PROGRESS IN MODERN BIOMEDICINE  年，卷(期)： 2007 7(7)  分類號(hào)： Q78  關(guān)鍵詞： 東北林蛙   Rana dybowskii   抗茵肽   cDNA   預(yù)測(cè)  

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