胰蛋白酶和苯酰氨類抑制劑結(jié)合自由能的預(yù)測

用基于線性響應(yīng)近似的自由能預(yù)測方法計算胰蛋白酶和苯酰氨類抑制劑的結(jié)合自由能.計算結(jié)果表明,單參數(shù),雙參數(shù)和三參數(shù)模型具有相似的線性回歸系數(shù),但三參數(shù)和雙參數(shù)模型的交互驗(yàn)證回歸系數(shù)要明顯優(yōu)于單參數(shù)模型.從預(yù)測能力來看,雙參數(shù)模型和三參數(shù)模型都能夠很好地預(yù)測測試集中抑制劑的結(jié)合自由能,其中雙參數(shù)模型預(yù)測的結(jié)果要略優(yōu)于三參數(shù)模型的預(yù)測結(jié)果.對測試集中的抑制劑,雙參數(shù)模型預(yù)測得到的預(yù)測自由能和實(shí)際自由能之間平均絕對誤差僅為1.15 kJ/mol.自由能計算模型以及分子動力學(xué)軌跡能很好地解釋抑制劑結(jié)構(gòu)和活性的關(guān)系,為藥物設(shè)計提供了重要的結(jié)構(gòu)信息.

作 者： 侯廷軍 朱麗荔 章威 喬學(xué)斌 徐筱杰   作者單位： 北京大學(xué)化學(xué)與分子工程學(xué)院,北京大學(xué)養(yǎng)生堂天然藥物研究室,北京,100871  刊 名： 化學(xué)學(xué)報  ISTIC SCI PKU 英文刊名： ACTA CHIMICA SINICA  年，卷(期)： 2002 60(6)  分類號： O6  關(guān)鍵詞： 線性響應(yīng)近似   胰蛋白酶   苯酰氨類抑制劑   分子動力學(xué)  

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